哥伦布死后不久，正德五年（1510年），曾随哥伦布远征印度群岛的迭戈·贝拉斯克斯·德·奎利亚尔（Diego Vesquez de Cuelr）率领300名西班牙远征队来到古巴岛，正式宣布古巴岛为西班牙的殖民地，并担任古巴岛总督。
  古巴岛东西长约1130公里，南北宽30-140公里，www.youxs.org。古巴岛有很多附属岛屿，最大的附属岛屿位于岛的西部松林岛，它北距主岛约60公里，陆地面积约2400平方公里，因岛上长满松林，故称为“松林岛”（今称“青年岛”）。古巴岛大部分地区地势平坦，岛的东南部是长约250公里、宽约30公里的马埃斯特拉山脉（Maestra Mountains），最高峰1972米；中部是长约80公里、宽约30公里的埃斯坎布拉伊山脉（Escambray Mountains），最高峰1140米；西部是以丘陵为主的瓜尼瓜尼科山脉（Guaniguaniountains），长约170公里、宽约25公里，最高峰约700米。古巴岛全境大部分地区属热带雨林气候，只有西南部沿岸背风坡为热带草原气候。与海地岛一样，全年分两季，每年的十月至次年的三月为旱季，四月至九月为雨季，年平均降水量在1000毫米以上，年平均气候在25c左右。古巴岛有砂金矿，但储量并不怎么丰富，在西班牙殖民者的大肆掠夺下，到嘉靖三十年（1551年），岛上的绝大部分砂金矿倒闭了，不过有些含金层较深的砂金矿，他们还没有发现，如在岛东部北海岸的萨瓜河（Sagua River）就有滨海砂金矿（今古巴梅加斯（Mejias）砂金矿）。岛上也有岩金矿，西班牙人还没发现。马埃斯特拉山脉有长约200公里的铜矿带，铜储量在1000万吨左右。早在1000多年前岛上的印第安人就在马埃斯特拉山区开采铜矿（纯铜），西班牙人于嘉靖九年（1530年）在山里发现了一个铜矿，过了6年才开采这个铜矿（今古巴埃尔科布雷（El Cobre）铜矿，截止到2000年，www.youxs.org，铜品位0.％）。马埃斯特拉山脉南部有约700万吨的锰矿。中部的埃斯坎布拉伊山脉、东南部的马埃斯特拉山脉有丰富的铁矿、镍矿、铬铁矿，铁矿矿石量达35亿吨、镍储量在650万吨、铬铁矿矿石量在1000万吨以上（今古巴有90个铬铁矿已采空，最大的铬铁矿矿石量100万吨）。古巴岛西部的瓜尼瓜尼科山脉有金矿、铜金矿、铅锌矿。古巴岛上还有丰富的油气资源（www.youxs.org，天然气储量294亿立方米，有34个油气井）、膨润土、高岭土、石灰石、石英砂、石膏、硫磺，也有少量的重晶石、石墨、石棉、云母、磷矿、宝石矿。古巴岛的附属岛屿松林岛（今称青年岛）也有钨矿、辉锑矿。
  西班牙殖民古巴岛后，迭戈·贝拉斯克斯·德·奎利亚尔在古巴岛建造了7座殖民城镇：
  正德七年（1512年）在岛东部建巴亚莫城（Bayamo，今古巴格拉玛省首府）。
  正德八年（1513年）在东部北海岸建圣母亚松森德巴拉科阿（ra Senora deAsun de Baracoa，今古巴东部北海岸的巴拉科阿城），并把它作为殖民地的第一个首府。
  正德九年（1614年）在埃斯坎布拉伊山脉南麓建圣特立尼达（ Santisima Trinidad，今古巴特立尼达城）、在埃斯坎布拉伊山脉东麓建圣斯皮里图斯（Sancti Spiritu）、在岛西部北海岸建圣克里斯托瓦尔·德拉哈瓦那（San Cristobal de La Habana，今古巴首都哈瓦那）、在岛东部南海岸建圣佩德罗·德·罗德拉洛卡（San Pedro deRoca）后来成为西班牙在古巴地区的首府，改名为圣地亚哥此后成为加勒比海盗频频袭击的目标，1640年建莫罗城堡）。
  正德十年（1515年）在中东部的北海岸建太子港（Puerto Principe，今努埃维塔斯（as）附近。
  此后，大量西班牙人开始移民到古巴岛。
  正德十四年（1519年），圣克里斯托瓦尔·德拉哈瓦那遭风暴摧毁，重建后称为“哈瓦那城”。
  嘉靖元年（1522年），圣佩德罗·德·罗德拉洛卡改名为圣地亚哥（Santiago）。
  嘉靖七年（1528年），太子港城遭风暴摧毁，西班牙殖民当局在距海岸70公里的内陆重建太子港（历史上，1897年古巴独立后，改名卡马圭城（Camaguey））。
  嘉靖八年（1529年），古巴古巴爆发了麻疹，杀死了三分之二的天花幸存者，其中大部分是印第安土著人。
  嘉靖九年（1530年），英国、法国、荷兰等国家的海盗经常入侵古巴岛，迫使西班牙不断向岛上增兵。
  嘉靖十八年（1539年），西班牙在古巴设置总督府，并将首府从圣母亚松森德巴拉科阿迁往圣地亚哥。由于岛上的土著人大量死亡，人口不足，西班牙当局从非洲引进大量黑人从事种植园和采矿工作，自此黑人逐渐成为古巴岛上的主体民族。
  嘉靖三十年（1551年），岛上的绝大多数金矿闭矿后，殖民当局在古巴岛的瓜纳沃河（Guanabo River，今属古巴哈瓦那省）、卡纳西河（Kanasi River，今属古巴马坦萨斯省）、阿里马奥河（Alimao Rive，今属古巴西恩富戈斯省）、阿加巴马河（Agabama River，今属古巴比亚克拉拉省）流域种植了大量甘蔗，也发展畜牧业。
  嘉靖三十四年（1555年），法国海盗攻陷了哈瓦那。西班牙军队夺回哈瓦那后，在哈瓦那湾口修建了莫罗（Morro）城堡。
  万历八年（1580年），殖民当局开始在古巴岛种植烟草。
  万历二十四年（1596年），西班牙殖民当局在哈瓦那建造了古巴岛上的第一家制糖厂，随后在圣地亚哥、巴亚莫也建造了糖厂，此后蔗糖业成了古巴岛的支柱产业。
  万历三十五年（1607年），西班牙在古巴岛的殖民当局将首府从圣地亚哥迁往哈瓦那。
  万历四十二年（1614年），殖民当局在古巴岛成立专门的烟草管理机构，烟草业逐渐成为古巴岛的第二个支柱产业。
  崇祯十年（1637年），由于西班牙人对古巴岛印第安人的屠杀，原有的30万土著人只剩下了5000人。
  崇祯十三年（16si0年），英国人进攻圣地亚哥，被西班牙人击退。西班牙人为了加强圣地亚哥城的防御，在圣地亚哥湾口也构筑莫罗（Morro）城堡（历史上，1673年重建城堡，因与哈瓦那的莫罗城堡重名，便改名为圣佩德罗德拉罗卡城堡（San Pedro deRoca Castle））。
  牙买加岛位于古巴岛南部约145公里，东西长约234公里，南北宽约82公里，www.youxs.org，仅次于古巴岛、海地岛，为印度群岛中的第三大岛。岛的东部为蓝山山脉，主峰海拔约2250米，中部、西部为丘陵和石灰岩高原，沿海有冲积平原。气候与古巴岛差不多，岛上尽管缺少地表河流，但泉水很多，因此岛上的印第安土著人——阿拉瓦克人称它为“牙买加岛”，意为“泉水之岛”。牙买加岛的铝矾土储量就达到25亿吨，岛上的石灰岩高原蕴藏着几十亿吨的石灰石。除了铝矾土、石灰石资源外，牙买加岛也有金矿（砂金矿、岩金矿）、银矿、铜矿、铁矿、铅锌矿、石膏矿等。
  哥伦布发现牙买加岛后，将它命名为“圣地亚哥岛”。
  正德四年（1509年），西班牙任命埃斯基维尔（ Esquivel）为牙买加总督。埃斯基维尔率100多名西班牙士兵在岛东南部登陆后，将附近的土著人全部杀光，然后建造了塞利维亚城，同时建罗亚尔港（Port Royal，也称卢瓦尔港），意为皇家港口（历史上，1655年英国人占领牙买加岛，1692年，塞利维亚城、卢瓦尔港在大地震中毁灭，英国人在原址上重建了城市，改称金斯顿城（Kingston））。西班牙殖民牙买加岛后，责令岛上的土著人开采砂金矿，但由于岛上的砂金矿并不丰富，很快就被殖民当局采挖殆尽了。由于西班牙人对阿拉瓦克人实行奴隶政策，没几年岛上的10多万阿拉瓦克人就因战争、疾病、奴役而灭绝。正德十年（1515年），西班牙从非洲运来了大批黑奴，黑人就成了岛上的主体民族，他们在岛上种植甘蔗、木薯、红薯、烟草等植物。嘉靖十七年（1538年），殖民当局在塞维利亚城西15公里建西班牙城，并将它作为总督府驻地。自万历年间起，来自法国、英国、荷兰等国的海盗经常袭击该岛。
  波多黎各岛位于海地岛东约118公里，东西长约153公里，南北宽约58公里，全岛以山地为主，中科迪勒拉山横贯全境，平均海拔900米，最高峰1338米。岛的西部为丘陵地带，多由石灰岩构成，南北沿海有狭窄的平原。全岛属热带海洋性气候，年降水量在1000-2000毫米之间，沿海年平均气温25c，中部山区的年平均气温在20c左右。波多黎各岛除了有丰富的石灰石资源和少量金矿、铜矿外，其它矿产资源比较匮乏。
  正德三年（1508年），曾随哥伦布远征印度群岛的西班牙人胡安·庞塞·德·莱昂（Juan Ponce de Leon）来到哥伦布发现的圣胡安岛，在岛北海岸建立了殖民点。正德四年（1509年）莱昂被任命为圣胡安岛总督，莱昂将“圣胡安岛”改称波多黎各岛（Puerto Rico Isnd），意为“富裕的海港”，将建立的殖民点称为“圣胡安”（San Juan）。莱昂担任总督后，听说岛上有黄金，就带人勘察了波多黎各岛，果真找到了几个金矿，于是他将岛上的土著人都驱赶到农场、金矿去做工，随着岛上的西班牙移民越来越多，他在圣胡安城附近建造了卡帕拉（Caparra）居民点。没过多久，岛上的十几万土著人泰诺人被消灭殆尽，西班牙人就运来了大批黑奴。从万历年间起，波多黎各岛也经常遭到英国、法国、荷兰等国海盗的袭击。
  哥伦布在发现了巴哈马群岛中的圣萨尔瓦多岛（今也称华特林岛）、圣玛利亚岛（今称朗姆岛）、费迪南岛（今称长岛）、伊莎贝拉岛（今称克鲁克德岛）、大伊纳瓜岛等岛屿后，担任波多黎各岛总督的莱昂也陆续发现了几个岛屿，如特克斯和凯克斯群岛（Turks and Caicos Isnds）、伊纳瓜，（长岛）由大巴哈马岛。正德八年（1513年）——正德十六年（1521年），莱昂率部远征北美洲的佛罗里达岛时，陆续发现了巴哈马群岛的安德罗斯岛（Andros Isnd）、新普罗维登斯岛（New Providengce Isnd）、大巴哈马岛（Grand Bahama Isnd）等岛屿。
  巴哈马群岛大大小小有700多个岛屿，www.youxs.org，最大的岛屿就是安德罗斯岛，长约170公里，宽约64公里，面积约6500平方公里。西班牙人发现巴哈马群岛后，因岛上并没有金矿、银矿、铜矿，就把居住在群岛上的印第安土著人抓到了古巴岛、海地岛、波多黎各岛去做奴隶，到正德十六年（1521年）巴哈马群岛成了荒无人烟的岛屿。此后，巴哈马群岛成了海盗的藏身之地。天启七年（1627年），英国人声称巴哈马群岛为英国领土，但还没移民建立殖民点。
  自哥伦布发现维尔京群岛后，西班牙人于嘉靖三十四年（1555年）派兵占领了维尔京群岛南部的圣托马斯岛（Saint Thomas Isnd），声称维尔京群岛为西班牙的领土，并把岛上的土著人抓走去做奴隶，但并没有在维尔京群岛上驻军。天启五年（1625年），一些英国人、法国人来到圣克鲁斯岛（Saint Croix Isnd）耕作，随后该岛成了海盗的避风塘。到目前为止，维尔京群岛的其它岛屿，如圣约翰岛（Saint John Isnd）、托尔托拉岛（Torto Isnd）、维尔京戈达尔岛（Virgin Gorda Isnd）等岛屿还没人居住。
  印度群岛的库拉索岛（Cucao Isnd，面积约444平方公里）、博奈尔（Bonaire Isnd，面积约288平方公里）于崇祯七年（1634年）被荷兰人占领；阿鲁巴岛（Aruba Isnd，面积约190平方公里）于崇祯九年（1636年）被荷兰人占领。圣文森特岛（Saint Vi Isnd，面积约344平方公里）于天启七年（1627年）被英国人占领；圣卢西亚岛（Saint Lucia Isnd，面积约610平方公里）于崇祯十二年（1639年）被英国人占领；安提瓜岛（Antihua Isnd，面积约280平方公里）、巴布达岛（Barbuda Isnd面积约160平方公里）于崇祯五年（1632年）被英国人占领；圣基茨岛（Saint Kitts Isnd，面积约176平方公里）、尼维斯岛（Nevis Isalnd，面积约90平方公里）于崇祯元年（1628年）被英国人占领。多米尼加岛（Dominica Isnd，面积约750平方公里）于（1632年）被法国人占领（注：今海地岛成立多米尼加共和国后，为避免混乱，将该岛称为多米尼克岛）；马提尼克岛（Martinique Isnd，面积约1130平方公里）于崇祯十一年（1635年）被法国人占领。瓜德鲁普岛（Guadeloupe Isnd，面积约1700平方公里）由西侧的巴斯特尔岛（Basse Terre Isnd）和东侧的格朗德特尔岛（Graerre Isnd）组成，于崇祯八年（1635年）被法国人占领。
  印度群岛的其它岛屿，如格林纳达岛（Grenada Isnd，面积约310平方公里）、圣文森特岛（Saint Vi Isnd）、圣卢西亚岛（Saint Lucia Isnd，面积约610平方公里）、安圭拉岛（Anguil Isnd）等还没被英、法、荷等国占领。
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