徐树铮从南通回上海，接到段祺瑞的来电，叫他暂时不要去北京。因为当时关外有张作霖和郭松龄的战争，天津有李景林和冯玉祥的战争，局面非常混沌。在北京是冯玉祥的势力范围，冯的嫡系鹿钟麟掌管了京畿军警宪的指挥权。段的策士曾毓隽也被鹿派兵抓了。段本人随时准备下野。在这种情形下，徐树铮如果入京，以徐平素为人之骄狂，又是段的最重要左右手，必定增加局势的严重性。
  小徐的毛病是胆大妄为，恃才傲物。他认为自己奉命考察，考察完毕理应回京复命。加以此次在欧美和日本普遍受各国领袖的重视，在北洋军人中，可算唯一有国际声望的人，谁敢对他如何？所以不顾大家的反对和段的电报，毅然决定入京。
  14年12月19日，徐树铮偕随员乘顺天轮由上海赴天津，23日抵津，宋子扬以轿车来迎，这辆轿车是借自英国领事馆的，徐登车后直驰北京，其余随员则乘火车赴北京。当天抵达北京，徐下榻无量大人胡同王宅，随员则分寓旅馆。
  小徐先单独晋竭段祺瑞，两人相对跪拜，抱头痛哭。这时是隆冬，天气严寒，段祺瑞病足，两腿要浸入冰桶中才能止痛。段、徐两人历经世变，重行聚首，相对不胜感慨。
  北京是小徐腾达之地，可是自直、皖一战，皖系溃败后，小徐就奔走四方，现在旧地重临，面目全非，段祺瑞虽然荣任执政，可是处处受制于人，有朝不保夕之势。小徐虽有勤王之心，也是无兵无勇。
  这时候北方局势渐见端倪，郭松龄出关兵败，夫妇双双陈尸白旗。天津苦战之后，李景林已逃之夭夭，冯玉祥的国民军奄有北京和天津，可是冯的地位并不很稳固，在这一期间南方吴佩孚困居武汉，孙传芳虎踞南京，奉张则元气大伤，在关外需要喘息。
  北京是个危城，尤其对徐树铮，因为大家都知道段祺瑞的临时执政是个光棍执政，可是如果小徐在段身边，就会兴风作浪，传说他和墨索里尼订有密约，接受意大利的军火援助。有此种种，小徐成为当时的一个目标，对段固然不利，对小徐尤为不利。
  所以在小徐到北京后一个星期，大家都劝他赶快出京南返，如果留京，可能有不利的事件发生。
  果然徐出京后，即在廊房遇害。噩耗传出，段为之痛哭，在北洋有大徐之称的徐世昌曾挽以联曰：
  道路传闻遭兵劫；
  每谓时艰惜将才！
  此联大徐在小徐杀陆建章时亦以挽陆。
  南通状元张謇挽联云：
  语谶无端，听大江东去歌残，忽然感流不尽英雄血；
  边才正亟，叹蒲海西顾事大，从何处更得此龙虎人。
  有关徐树铮遇害经过，这里抄几段有关人士的记叙。
  第一段是抄录徐的哲嗣徐道邻所撰遇难经过如下：
  先生于十二月十九日离上海，二十三日到天津，当天到达北京。二十九日，忽然决定要出京南返。嘱咐路局准备专车。在当天的下午，段执政在他的书桌上，忽然发现一个字条，上有“又铮不可行，行必死”八个字。段很着急，赶快命人把字条给先生，但先生并不介意。晚上到车站时，褚哲文带了一连人来预备护送，先生坚决不要。
  专车九时开动，因一路兵车甚多，到夜半一时左右，才到廊房。车才停，即有一自称张之江的参谋长王某者（贵州人？），持张的名片请他下车。说话之间，即有兵士十余人，蜂拥而上，挟持先生下车，走到离站约一里许的地方枪杀，那时是三十日上午一点半钟。先生的随员（有褚其祥、薛学海、徐赞化、孙象震、韩宾礼、刘卓彬等），全体被拘于设在英美烟公司的司令部之马棚。
  黎明七时，先生的随员们被召集于会议厅。一会儿，破汽车四五辆，拖着一路灰尘，疾驰而至。那是陆承武奉冯玉祥之命，才从天津英租界赶来。他对他们演说，说先生不忠不孝，不仁不义，他今天要刮肉剜心来报父仇。他还不知道先生已于六小时前被害。
  随员们又被“军法官”等审问了八小时，于下午五时，张的副官长告诉他们“徐某系陆承武所杀，乃冤怨相报。君等获释，皆张督办（之江）力保之功”。并命令他们各具切结，打手印，宣誓不泄漏一字，否则各人全家性命难保。还全体照了一张相片，每人给了短程车票钱，才准他们只身空手离开廊房。
  第二天，报上登出来陆承武的通电，说他手刃徐某，为父报仇。又登出来冯玉祥打给段执政的电报，说徐上将有功国家，不幸在路面为匪人劫害，其死甚惨，请政府优予褒恤云云。可是政府并没有任何动作（我想，这是段执政的一种沉默的抗议）。但是在三十日那天，上海的《时报》就已经登出徐专使专车被炸的消息来。这是冯方预发的消息，而后来事情发展走了样，所以就格外露出马脚来。
  原来张之江接到冯玉祥的命令，是叫工兵队埋地雷炸专车。张却没有这样作（我想是因为来往的兵车原因。也有人说张是基督徒，心地善良，不愿伤害太多的人）。自先生被害之后，冯命令把随员们全部杀害，据说也是张一再苦求，才把他们释放了的。
  先生被害的第二天，张之江的卫生处长洪君——段宏纲说，他本来姓段，名字叫段大洪——自称是先生的学生，愿以一门老小作保，两次跪着哀求张之江，请求寻尸装殓（他只要求殓葬，不敢说要运走）。张教他负具切结，结上一定要有徐某被陆某复仇所杀的字样（他因此写过两次结帖），才勉强允其所请。洪君一整夜在雪地里苦寻了两遍，才找到先生的遗体。又好不容易买到了人家一口寿木，把他装殓起来。第三天，由先生的卫士张振声用骡车运到北京。洪君因此大受张之江抱怨，就脱离了他的部队，也就从此长斋念佛了（我到处访求洪君的下落，前后二十年，未获踪迹。等我告了冯玉祥，洪君忽然写信给我，并把他手里保存的当时所有书面材料相片等寄来一大包，并追述当时求情寻尸经过，五千多字，一字一泪。他说他等待这一天，也等了二十年了）。
  先生入殓和被害的原因，我的推测，主要的是和墨索里尼的军火借款协约有关。因为这是先生当时的一笔大本钱。据说先生当时把这项秘密只透露给三个人：一是段执政，二是冯玉祥，三是孙传芳（这是我闻之于曾毓隽先生的，而曾则是闻之于孙的参谋长刘宗纪）。先生在这半年中，一直是联络冯玉祥的，他派在冯那里的，有他以前的旅长宋子扬。他在国外时，冯常常有电报，称他“钧座”，自称“职”，口口声声要他回来“主持”“领导”等等。在七八月中，杨宇霆督苏的时候，先生曾经发表一通长电反对他——当时有人说，这一个电报等于三个师的兵力——打击奉天，就是帮助冯玉祥的。当十一月中，冯、张交恶已深，亲奉的曾毓隽、姚震先后被冯军拘捕，段执政左右，很多人逃避到东交民巷里。当时大家认为北京危险，劝先生不要去，就是这个原因。但是他们不知道先生和冯有这样的密契。先生敢于轻身入险的，就是这个原因。段执政大概也认为这个密契可能有作用，所以在先生出京时，虽然得到那八个字的严重警告，并没有尽全力加以拦阻。先生之忽然决定离京，是十二月二十九日，那是郭松龄失败后的第四五天。郭的失败，就是张作霖的胜利。他的忽然要离京，我想也许是他怕和段执政同时被困在张作霖的手中。他既然怕张作霖，当然就不会怀疑到冯玉祥。
  冯玉祥要害先生，我想有三个理由：
  一、先生和墨索里尼的协议，使先生如虎生翼。现在和冯合作固然是好，但如一旦翻脸，必然后患无穷。不如趁他蛟龙尚未得水之时，予以除掉，以消灭未来的隐患。
  二、先生当时反共的态度，是十分明显的……。
  三、冯玉祥不但是陆建章的亲外甥，而且是受过他的厚恩和接受过他的领导的。元年滦州独立，冯被押解回籍，是陆把他保出来的。而后来也是靠着陆的力量，冯才再度挂名军籍。浦口逗留（七年一月），武穴通电（七年二月），也全都有陆在旁为之策划。所以在冯、陆之间所存在的，并不只是泛泛的甥舅之谊而已。冯玉祥之要加害先生，不会没有一点为舅舅报仇的成分在内。
  十五年十一月里，旧历十月二十九日，先生安葬于萧县凤冢山之原，就是他少年游憩的地方。
  先生安葬的棺木，是合肥购赠的。但是“抚恤”、“惩凶”的一类官样文章，始终缺如。我过去为这一点，一直对合肥不满。但是后来看到他《正道居集》内的几篇文章，才了解他真的是相信“轮回”、“因果”之说。后来又看到曾宗鉴先生在一段笔记里说：十五年四月，合肥下野出京，“专车开出后一小时，合肥步入车厅，问车过廊房停留多久？又问‘又铮遇难是否即在车站’？及车过廊房，合肥开窗西望，历十分钟，口唇微动，喃喃若有语，老泪盈眶，掩面入卧”（天文合，四十四年七月十日）前几年又在台北看到合肥的孙子昌义，他说“爷爷嘱咐的，每年摆供，祖先牌位旁边，必须要摆徐爷爷的牌位，给徐爷爷磕头。”我于是格外明白老人家心里，自有他的分寸。
  第二段是冯部张之江的参谋长张钺所口述徐树铮惨死经过：
  张之江和鹿钟麟，都是冯玉祥的心腹干部，不过两人的性格大不相同，张是个忠实基督教徒，对事对人都极端诚恳。鹿则机警细密，处事谨慎，且善于体贴冯的心理，先意承旨，极为冯所信任。他此时正担任北京卫戍总司令职务，故冯玉祥特别指定他为杀徐第一号“刽子手”。