河中地区其他的古城还有伊斯塔拉夫尚、卡尔希、彭吉肯特、沙赫里萨布兹等。
  伊斯塔拉夫尚（Istaravshan），位于苦盏西南70公里、tu厥斯坦山北麓，是古塔吉克人建造的城市。亚历山大大帝占领该城后，赐名为“塞洛普”（Cyropol）。我国战国时期，安息帝国（即帕提亚王朝）称它为“克尔城”（Kir）。我国汉代时期称为“大宛城”，即大宛国的都城，张謇出使西域时就到过这里。阿拉伯人占领此城后，改名为“伊斯塔拉夫尚”。从伊斯塔拉夫尚沿着亚格诺布河谷翻越阿赖山脉主脊，再沿着瓦尔卓布（Varzob）河谷南行，就能到达苏尔汉河谷的吉萨尔城（也称希萨尔城）。
  卡尔希（Karshi），位于撒马尔罕西南130公里的卡尔希绿洲中心。成吉思汗时期建城，长春真人丘处机访问该城时，称它为“那色波”。察合台汗国时期改名为“卡尔失”。帖木儿占领该城后，在此筑城堡，并将城市改为“卡尔希”（Karshi））。
  彭吉肯特（Panchakent），位于撒马尔罕东60公里的泽拉夫尚河河谷。古雅利安人来到西域后，有5户人家在此定居。后来他们在该地建城，称为“索格迪亚纳”（Sogdiana）,是西域最古老的城市之一。古雅利安人还以该城为中心，建立了“索格迪亚纳”城邦。亚历山大大帝东征时摧毁了该城，亚历山大大帝死后又重建了城市，改名为“彭吉肯特”，意为“五个定居点”。
  沙赫里萨布兹（Shakhrisyabz），位于撒马尔罕南70公里。汉代时期称为“渴石城”（Kesh），为史国的都城。东察合台时期，帖木儿就出生在该城。帖木儿建立帝国后，在该城建了新的宫殿，作为帝国的陪都，将该城称为“沙赫里萨布兹”（Shakhrisyabz）。
  在突厥斯坦城西北约280公里的锡尔河中下游有一片面积约1万平方公里的绿洲，因那里长满着芦苇，哈萨克人便把它称为“卡姆斯特卡拉”（Kamstra），意为“芦苇之地”（今称克孜勒奥尔达）。
  在锡尔河的下游有一片面积约7千平方公里的绿洲及面积约1600平方公里的三角洲湿地，那里布满着很多沼泽，沼泽周围不仅长有芦苇，也长满着树木、灌木，哈萨克人把那片绿洲称为“库姆巴扎尔”（Kumbazar），把锡尔河三角洲称为“塔斯塔克”（Tastak）。
  目前，锡尔河中下游的卡姆斯特卡拉、库姆巴扎尔、塔斯塔克都是哈萨克人的牧地。今后我们占领锡尔河流域后，可以在卡姆斯特卡拉、库姆巴扎尔、塔斯塔克等绿洲内填平沼泽、开垦荒地、开挖灌溉渠道后，用来种植水稻、麦子等农作物。不过，由于锡尔河的泥沙量很大，大量的泥沙冲入咸海后，导致咸海东海岸线每年都有变化，因此今后开发利用锡尔河时，要综合考虑锡尔河流域的平衡发展，否则会引起锡尔河下游的盐碱化，甚至会导致咸海水面面积大减，影响整个咸海地区的生态环境。
  突厥斯坦城、塞兰城的北部是卡拉套（Karatau）山。卡拉套山北部流淌着塔拉斯河（Tas River），在唐代称为“怛罗斯河”。它发源于南天山西延的余脉塔拉斯山（也称塔拉斯阿拉套山）、吉利吉斯山（今称吉尔吉斯山）之间的峡谷，自峡谷流出后，一直向西流，到吉利吉斯山西端后，折向北流约50公里，再拐向西北流，最后消失在穆云库姆（Muyunkum）沙漠，全长约660公里。
  在吉利吉斯山西端的塔拉斯河畔有一座古城——塔拉兹城，该城是北匈奴人强迫康居人建造的，唐代时称为“怛罗斯城”，是丝绸之路上的重要城镇。天宝五年（公元751年），高仙芝率领的唐朝安西都护府的军队在这里与阿拉伯帝国的军队进行过激战（史称怛罗斯之战）。花剌子模打败西辽后，占领了塔拉兹。成吉思汗西征花剌子模时，摧毁了塔拉兹城，派兵在此屯田，令耶律楚材管理该地区。金帐汗国时期重建了塔拉兹城，后被察合台汗国夺取。哈萨克汗国崛起后，塔拉兹城被哈萨克人占领。
  吉利吉斯山的东南部是南天山北部的余脉泰尔斯凯山脉（Terskey Range，也称泰尔斯凯阿拉套山）。东北部是昆格山（Kungey Range，也称孔根阿拉套山、伦盖阿拉套山）、外伊犁山脉，泰尔斯凯山与昆格山脉之间有个大湖，我国史书上曾称它为“热海”、“清池”，蒙古人称它为“特穆尔图淖尔湖”，吉利吉斯人称它为“伊塞克湖”。伊塞克湖东西长约178公里，南北宽约60公里，湖面面积约6236平方公里，湖面海拔约1607米，平均水深278米，最大水深702米，为不冻咸水湖。
  费尔干纳山脉、塔拉斯山脉、泰尔斯凯山脉与南天山余脉古玛塔格山脉（今喀什北部的山脉）www.youxs.org，因盆地内有纳伦河流过，故将该盆地称为“纳伦盆地”。
  伊塞克湖地区、纳伦盆地内有众多沟谷，沟谷两岸水草丰美，可以放牧。居住在那里的主要是布鲁特人，他们以放牧为主，也有部分布鲁特人在伊塞克湖沿岸开垦了少量耕地种植庄稼。
  锡尔河中游、塔什干、费尔干纳盆地原是察合台汗国的土地，察合台汗国分裂后，塔什干、费尔干纳盆地成为东察合台汗国的领地，而西察合台汗国被帖木儿帝国吞并。
  哈萨克人脱离乌兹别克人的统治后，东察合台的也先不花接纳了哈萨克人，并把库奇巴什（位于楚河、塔拉斯河之间）一带划给哈萨克人放牧。乌兹别克人的昔班尼为了打败帖木儿，曾向东察合台借兵。也即东察合台都曾是哈萨克人、乌兹别克人的恩主。但不久后哈萨克人、乌兹别克人就都背叛了恩主，从东察合台那里夺取了大片土地。因此东察合台的后裔叶尔羌人与哈萨克人、乌兹别克人有不共戴天之恨，一百年多来，哈萨克人、乌兹别克人、叶尔羌人围绕着费尔干纳盆地、塔什干，不断重复着“三国演义”。
  成化四年（1468年），哈萨克人趁乌兹别克的阿不勒海尔汗去世之际打败乌兹别克人，迫使继位的昔班尼逃往帖木儿帝国的tu厥斯坦城。随着军事上的胜利，哈萨克人就向恩主东察合台发起了进攻，夺取了东察合台的大片土地。弘治十六年（1503年），昔班尼打败昔日的恩主、东察合台的马哈木汗，占领了塔什干、费尔干纳盆地。正德五年（1510年），哈萨克哈斯木汗趁昔班尼与波斯人发生冲突时，打败了乌兹别克人，占领了塔什干，同时占领了锡尔河中游的tu厥斯坦城，控制了锡尔河流域，并不断威胁费尔干纳盆地。昔班尼战死后，他的侄子速云赤继位，于正德七年（1512年）打败入侵河中地区的巴布尔后，乘胜反击哈萨克汗国，夺回了塔什干。正德八年（1513年），哈萨克人与东察合台人建起联盟，共同对抗乌兹别克人。正德九年（1514年），退到塔里木盆地的赛依德建立了叶尔羌汗国后，被喀尔喀蒙古挤压到阿尔泰山西部的卫拉特蒙古进攻叶尔羌、哈萨克，乌兹别克人也从南部进攻哈萨克，哈萨克、叶尔羌就于嘉靖四年（1525年）结盟，对抗乌兹别克、卫拉特蒙古。待打败乌兹别克人、卫拉特蒙古人后，哈萨克汗国就撕毁协议，进攻叶尔羌汗国。嘉靖十二年（1533年），拉失德继承叶尔羌汗位后，为了对付哈萨克人的入侵，与宿敌乌兹别克人结盟，打败了哈萨克人。万历二十年（1592年），布哈拉汗国趁叶尔羌大汗阿布都哈林（也称阿布都克木）去世之机，出兵10万进攻叶尔羌汗国，经血战，继位的叶尔羌大汗马黑麻打败了布哈拉人。万历二十六年（1598年），哈萨克汗国的塔吾克勒汗趁乌兹别克人分裂，内部诸侯割据严重时，与叶尔羌汗国结盟，率军10万进攻布哈拉汗国，在占领了费尔干纳盆地、塔什干后，围困了布哈拉城。危急时刻，布哈拉汗国的各封建领主同仇敌忾，组成联军，击退了围困布哈拉的哈萨克人。此后，叶斯木汗（也称额斯木汗）继位，他为了对付北部的卫拉特蒙古人，与布哈拉签订了和约，规定撒马尔罕地区、塔什干城地区、费尔干纳盆地在240年内归哈萨克汗国管辖。哈萨克、布哈拉签订和约后，叶斯木汗专心对付卫拉特蒙古。不过，叶斯木汗为了防备乌兹别克人撕毁条约，在塔什干设有总督，还驻有重兵，称为“南方军团”。天启七年（1627年），叶斯木汗的堂叔、塔什干总督吐尔逊·穆罕默德发动叛乱，被叶斯木汗平定，随后叶斯木汗就派乌孙部首领加朗脱思（也叫加蓝托斯）担任塔什干总督。
  万历四十七年（1619年）阿不都·拉提甫继承叶尔羌汗位，天启七年（1627年）叶尔羌汗国趁哈萨克汗国刚刚平定吐尔逊·穆罕默德的叛乱之机，出兵进攻哈萨克汗国，占领了费尔干纳盆地、塔什干，将疆土基本恢复到了东察合台汗国时期。崇祯三年（1630年），阿不都·拉提甫去世后，叶尔羌汗国陷入了内乱，哈萨克汗国趁机又夺回了费尔干纳盆地、塔什干。崇祯十一年（1638年）吐鲁番总督阿不都拉哈率军进入叶尔羌城，终于再次统一了汗国，稳定了局势。崇祯十三年（16si0年），阿不都拉哈西征费尔干纳盆地，被盆地内的吉利吉斯人偷袭，死伤惨重，不得不退回叶尔羌城。崇祯十五年（16si2年）布哈拉汗国的纳迪尔·穆罕默德继位后，因治国无方，国内的乌兹别克部落形成了很多联盟，实行领地自治化，纳迪尔·穆罕默德不得不到处平乱。崇祯十六年（16si3），阿不都拉哈再征费尔干纳盆地，仍然无功而返。此后，阿不都拉哈专注于发展经济，将政务交给了黑山派的和卓们管理。
  “和卓”来自于波斯语，意为“贵族”、“宦官”，几经演变后，在西域的YSL教用语中成为“圣裔”的意思，也即是阿拉伯哈里发的后裔，代表着神圣的血统和身份。叶尔羌汗国从萨亦德（也称萨义德）汗便信奉YSL教苏菲派中的纳克什班底教派，拜来自河中地区的纳克什班底教派第三代教长阿和拉尔之孙玉苏甫为师，这个“玉苏甫”就号称“和卓”。纳克什班底教派在第五代教长马哈图木去世后，就出现了分裂。马哈图木长子额敏一派的教徒因戴白帽子，被称为“白山派”，他们主要在喀什噶尔一带传教，也获得了居住在纳伦盆地、伊塞克湖地区的布鲁特人的支持。马哈图木四子伊斯哈克一派因戴黑帽子，被称为“黑山派”，他们除了在都城叶尔羌一带传教外，还在于阗（今和田）、阿克苏、吐鲁番一带传教，还获得了居住在帕米尔高原一带的布鲁特人的支持。马黑麻在做王子时，就拜伊斯哈克为师。马黑麻继承汗位后，伊斯哈克就成了“国师”。万历二十年（1592年），布哈拉汗国进攻叶尔羌汗国时，黑山派协助马黑麻作战，动员了大量教徒加入了军队，为击退布哈拉人立下了汗马功劳。马黑麻击败布哈拉人后，致力于发展经济，而把政务交给了黑山派的沙迪和卓。马黑麻去世后，黑山派继续干预国政。黑山派的成功，刺激了白山派，于是在泰昌元年（1620年），白山派的玉素普也来到了叶尔羌，与黑山派开始公开争夺话语权，但因沙迪被封为“国师”，因此白山派一直被黑山派压制着。天启七年（1627年），叶尔羌汗国占领费尔干纳盆地后，黑山派也进入了费尔干纳盆地，在费尔干纳盆地内大肆培植自己的势力。哈萨克夺回费尔干纳盆地后，黑山派继续在盆地内传教，盆地内的乌兹别克领主也在黑山派的鼓动下，开始领地自治。
  今后我们征服叶尔羌汗国、哈萨克汗国，如任凭黑山派、白山派干政，必将出乱子，因此必须严令他们不得干政，违者杀无赦。我们向塔里木盆地、费尔干纳盆地移民后，一定要在那里建佛庙、道观，推行宗教自由。如有阻扰建庙、观者，或强制汉人改宗YSL教者，也必须严惩。
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